Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NischQ80TM9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms