Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms