Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Clec18aQ7TSQ1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Clec18aQ7TSQ1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Clec18aQ7TSQ1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Clec18aQ7TSQ1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Clec18aQ7TSQ1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Clec18aQ7TSQ1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Clec18aQ7TSQ1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Clec18aQ7TSQ1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms