Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LnpkQ7TQ95 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LnpkQ7TQ95 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms