Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrc2bQ7TPM1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms