Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Mycbp2Q7TPH6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Mycbp2Q7TPH6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Mycbp2Q7TPH6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Mycbp2Q7TPH6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Mycbp2Q7TPH6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Mycbp2Q7TPH6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Mycbp2Q7TPH6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Mycbp2Q7TPH6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms