Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nphp3Q7TNH6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms