Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms