Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmed3Q78IS1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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