Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Higd1cQ76I25 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms