Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2r2Q6ZWZ2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms