Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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