Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfflQ6ZQM0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfflQ6ZQM0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms