Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ncapd3Q6ZQK0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd3Q6ZQK0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms