Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
March6Q6ZQ89 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
March6Q6ZQ89 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms