Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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