Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LcorQ6ZPI3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms