Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssx9Q6XAS3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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