Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms