Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms