Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms