Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfrlQ6PE55 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms