Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1cQ6PDZ2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms