Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85bQ6PDY0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms