Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms