Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trak1Q6PD31 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms