Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Papd7Q6PB75 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Papd7Q6PB75 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms