Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gapvd1Q6PAR5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gapvd1Q6PAR5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms