Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atl2Q6PA06 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms