Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fhod1Q6P9Q4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms