Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms