Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RbfaQ6P3B9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms