Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E8

Efcab6, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab6Q6P1E8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcab6Q6P1E8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcab6Q6P1E8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms