Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL8

Scube1, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube1Q6NZL8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scube1Q6NZL8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms