Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms