Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SphkapQ6NSW3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SphkapQ6NSW3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms