Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms