Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh1Q6IUP1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms