Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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