Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ8

Gm5414, MCG1050941, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5414Q6IFZ8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5414Q6IFZ8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm5414Q6IFZ8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5414Q6IFZ8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5414Q6IFZ8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm5414Q6IFZ8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Gm5414Q6IFZ8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm5414Q6IFZ8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm5414Q6IFZ8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm5414Q6IFZ8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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