Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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