Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms