Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop58Q6DFW4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms