Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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