Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep290Q6A078 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms