Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp4fQ66X05 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms