Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms