Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc3Q64519 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms