Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprdQ64487 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms