Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf1Q64213 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms